在夜色的掩护下，全团官兵最终艰难地进入青龙山区。然而，这一进入，他们再也没有出来，从此消失得无影无踪。在“溶洞”说之外，还有各种各样的猜测、假想被提出，归纳起来主要有四个方面：第一，跟所谓的地球“黑洞”有关。有学者认为，地球“黑洞”是人眼看不见的引力世界。所以，历史上神秘失踪的人、船只、飞机等，实际上是进入了这个神秘的“黑洞”中。第二，“时空隧道”所致。
神秘事件之1937年川军团二千余人失踪之谜
一些学者认为，神秘失踪是正负两大物质体系产生引力场后，发生局部弯曲时产生的“湮灭”现象。第三是“静电浮力”说。有学者认为，陨星在落向地球的过程中，可以产生高达10亿伏的电压。很多时候，陨星尚未落到地表就分崩离析了，只有巨大的能量波冲击地表，产生静电浮力。这种情况下，大群的人、船只甚至火车都有可能被吸浮到空中或转移到很远的地方。第四，遭UFO外星人劫持。对于地球之外的力量这些说法，中国科学院地质与地球物理研究所的王妙月研究员不以为然。他认为，从基础地球物理知识来看，地球“黑洞”不可能存在。因为从地球密度分布和质量来讲，地球表层密度较小，随着向内部的延伸，密度会逐渐增大。而地核离地球表层非常远，这种引力还不至于把如此多的人给吸进去。
对于“静电浮力”说，他认为，陨石本身不会产生电压，而且在掉落过程中电荷会自动跑掉，即便到了地表也不会积留太多，所以失踪人群被静电浮力转移的可能性不大。王妙月研究员对集体失踪事件的可信度还持有怀疑。他说：“历史上所有的失踪案，最大的可能还是因为各种原因的遇难，比如发生滑坡或者泥石流等灾难，将很多人掩埋。”
对于官兵失踪原因，不少人认为与青龙山的溶洞有关。这些官兵可能躲进某处一鲜为人知的巨大溶洞，后因敌机轰炸震塌洞口，致使全体人员窒息而死。一个未经证实的消息是，20世纪70年代初，青龙山区的南京矿校学生和驻军建矿井、采煤，无意中发现过几个洞穴里有几顶锈烂的军用钢盔、朽坏的步枪和几具骸骨。另外，在青龙山区，近十几年来时有古溶洞被发现。传说山中有一个很大的溶洞，如用铁锤敲击岩壁，可隐隐听出空声回音……这更使得一些人对部队死于溶洞的说法深信不疑。但研究南京保卫战的众多专家学者并不认同此说。他们认为，青龙山自古就是兵家必争之地，除了大大小小的溶洞外，部队还开凿了不少防空洞。南京保卫战期间，青龙山战斗进行得十分激烈，敌我死伤惨重，几十年后发现一些遗骸和军备物资，也属正常。