在中央研究院的成立典礼上，胡适院长邀请蒋介石出席，蒋介石讲话里批评了“新文化运动”，批评“打倒孔家店”这样的口号。蒋介石讲话以后，胡适发言，第一句话就是“总统您错了”，当面驳斥了他，所以他在日记里写，最不喜欢胡适，而且以后不愿意见到胡适，但是尽管如此，蒋介石在胡适去世后，还是评价他为“新文化中旧道德的楷模，旧伦理中新思想的师表”。
在审判雷震那段时间，蒋十分注意国外的反应，而将一切不利反响与批评意见全归之于胡适：
“本月工作以雷震案为重点，自四日逮捕至廿六日起诉作为第一阶段，除国内外少数反动言论外，一般反响并不如所预想之激烈，惟一纽约《时代》杂志乃受胡适之影响，亦作不良之评论，殊出意外。”(1960年9月30日，“上月反省录”)
10月，蒋闻胡适将从美国返回台湾，颇感紧张与头痛：“闻胡适定于十六日回来，是其想在雷案未覆判以前要求减刑或释放之用意甚明。此人实为一个最无品格之文化买办，无以名之，只可名曰‘狐仙’，乃为害国家，为害民族文化之蟊贼。”(1960年10月13日)
