数年来，专家从未放弃皇陵的复原工作，不断在周围进行勘探，曾经打下了上万个钻孔，想要探寻皇陵的地下结构，结果表明整个皇陵大致可以分为4个层次，仿制咸阳城的构造，主次分明，内外城相结合，城墙厚度可达6米以上，地宫中通道复杂，不明所以的人很容易失去方向，在外城上清晰可见有几个盗洞，不过这些盗洞距离真正的地宫内室还有很长一段距离，可见盗墓贼并没有顺利进入主墓室。
秦始皇生前俾睨天下，死后也想将山川河流一并带走，然而这一想法显然很难实现，必须扩大墓室的规模，此外专家发现了一个奇怪的现象，大多数帝王陵均是坐北朝南，而秦皇陵却选择了东西走向，因此有人认为秦人习惯面向西方，彰显自己的来路。
这种走向无疑加大了盗墓贼寻找墓室的难度，此外墓中水银浓度严重超标，很可能存在一条灌满水银的“河流”，如果被挖开的话就会造成泄露，到时候盗墓贼也会插翅难逃，更别说深入到地宫内部，地宫呈方形，是整座墓室的核心，深度可达50米。
地宫是集中堆放陪葬品的地方，至于地宫的选址也有一番来历，史料记载工匠在挖掘到一定深度的时候遇到了难题，再也无法深入，据说有人看到此处有一道巨大的鸿沟，每到夜晚，鸿沟中就会传出阵阵叫声，犹如阴兵过境。
