华南海鲜市场测序分析:早期案例并不都出于此,病毒源头或更复杂

2020-03-30 05:24     健康时报

当地时间2020年3月27日,悉尼大学生命与环境科学学院、医学科学学院爱德华·霍尔姆斯(Edward Holmes)教授和上海市公共卫生临床中心、复旦大学生命科学学院张永振教授联合在《细胞》(CELL)杂志上发表一篇评论“A Genomic Perspective on the Origin and Emergence of SARS-CoV-2”。

华南海鲜市场测序分析:早期案例并不都出于此,病毒源头或更复杂

该评论通过系统梳理目前所知的各项研究中关于新型冠状病毒出现的基因组数据后,就现有成果总结认为:“从武汉华南海鲜市场上采集的‘环境样本’的基因组序列现已被获取,据进化分析显示,它们与从武汉最早的病人身上采集的病毒非常接近”。但霍尔姆斯教授和张永振教授同时指出,由于“并非所有的早期COVID19案例都与该市场有关,因此病毒源头可能比最初猜测的更复杂”。该评论认为,尚不清楚样本是否来自经过市场的感染者还是源自该地点的动物。但对该市场目前已经缺少明显直接的动物采样,这意味着做出判断将很困难。

张永振教授团队是世界上最早发布新型冠状病毒全基因组序列的研究团队。在全球6000多种病毒中,张永振团队就发现了2000多种。他所在的上海市公共卫生临床中心团队在2020年1月5日凌晨就从武汉华南海鲜市场的一名病人身上送检的标本中检测出一种全新的冠状病毒,并通过高通量测序获得了该病毒的全基因组序列。并于1月11日发布,团队在《病毒学组织》网站发布了所获得的新型冠状病毒全基因组序列。

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