科技日报:新冠病毒变异成两个“亚型”?并非实锤!

2020-03-09 09:35     澎湃新闻

原标题:科技日报:新冠病毒变异成两个“亚型”?并非实锤!

科研论文表示新冠病毒或已发生变异

近日,新型冠状病毒是否变异引发关注。公众对于冠状病毒发生了什么样的变异,病毒变异是否影响它的致病性和传播力等问题产生很多疑问,科技日报记者带着这些问题咨询了多位基因组学领域和病毒学领域的学者。

病毒变异常见,“质变”还未到来

“病毒变异是非常常见的,每个毒株的病毒序列都或多或少有所不同。”美国加州大学圣地亚戈分校医学中心副教授李克峰介绍,病毒毒株之间的不同和“千人千面”有着相似的道理。

日前,论文《关于SARS-CoV-2的起源和持续进化》在对百余株新冠病毒毒株的全基因组序列比对后发现,病毒在基因组上一个蛋白编码位点的突变形成了两“组”,被媒体称为“亚型”。“目前看,这个程度的变异造成的差异不足以叫‘亚型’,叫分枝(clade)比较合适。”有病毒专家表示,“亚型”有独特的意义,不同病毒的定义不一样,不是只要有一两个突变就可以分出“亚型”。

科技日报:新冠病毒变异成两个“亚型”?并非实锤!

相关专家表示,这个病毒刚刚发生还没多久,不可能有太大的变化,根据对病毒现有的认知,病毒的变异速率大约为每年1000个碱基中发生1个碱基的变化,只有在关键位点的变化才能导向突出的变异。

针对新冠病毒变异会不会影响疫苗研发的问题,中国科学院副秘书长、中国科学院院士周琪回应称,目前,病毒变异并没有影响到药物研发、抗体制备和疫苗制备。在病毒变异的过程里面我们需要更多案例,也需要更多深入研究。目前研究人员正在积极地观测病毒变异程度、布局科研项目。

序列共享,实现真正的大数据挖掘

目前的基因序列对比研究的样本量大多为百余例左右。李克峰认为,研究样本量太少,并不能说明是什么时候变异的以及是否在武汉变异的。

此外,对于冠状病毒样本的数据挖掘,还应该注重代表性,例如该论文选用的数据中,武汉样本多是元旦前后,1月底前后的样本多集中于国外,还有少部分1月中旬的广东、云南的样本数据,分散的数据很难讲通病毒繁衍、进化、传代的“故事”。

“数据数量的严重缺乏,很可能造成片面的分析结果。”一位国家科学数据中心负责人介绍,据国家生物信息中心(国家基因组科学数据中心)建立的2019新冠病毒信息库发布的统计,目前全球公开的新冠病毒序列有283条,其中只有200个全基因组序列。这对于数据挖掘的需求而言相当于“杯水车薪”。

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