作为日本联合海军的主要对手，美军不仅大量应用雷达进行预警，同时还能升空数量众多的各式飞机进行战斗巡逻，日本的攻击机群很难在不被发现的情况下抵近盟军舰队，而一旦被发现，航速和机动都远远落后于战斗机的九九式完全就是移动的靶子。
列克星敦号航母
随着日军战事陷入不利局面，日本开始了神风攻击，大部分的日本新手飞行员带着炸弹企图撞向盟军战舰，最好是以一机换一舰的方式完成最后的作战。这种作战模式给盟军造成很大的损伤，例如冲绳战役期间，有１０３架舰载机发起了神风攻击，战果为击沉一艘驱逐舰，重创和轻伤各一艘驱逐舰。老实说这样的战果确实很差劲，但是这种不要命的打法却让许多盟军水手从心理产生了恐惧。
因为后期执行太多神风攻击任务，一般飞行员被任命为九九式驾驶员，基本也就意味着他的生命进入最后倒计时，因此日军飞行员都称九九式为“九九式棺材”。
准备发起神风特攻的九九式
尽管九九式在后期战场上完全处于被吊打的状态，但不可否认的是在前期它是一款可靠的武器装备，据统计它是二战期间击沉战舰最多的一型舰载机。它的没落真正原因是日本穷兵黩武，一心想要称霸世界，到处入侵其他国家破坏他国的主权，这种原本就不正义的行为不管拥有如何先进武器也是会最终失败的。
