2003年3月，伊拉克战争爆发后，易卜拉欣被萨达姆任命为北方战区司令。在伊北方重镇陆续失守后，易卜拉欣消失在公众视野外。萨达姆政权彻底垮台后，易卜拉欣纠集了一些萨达姆政权拥护者，在他领导下继续与美军进行战斗。在美军发布的“扑克牌通缉令”中，他是排名第六的“梅花Ｋ”。据不完全统计，在伊拉克中北部地区，他在幕后指挥了至少150起针对美军的袭击行动。
除搞袭击外，易卜拉欣也设法通过中间人与伊拉克政府展开尝试性接触，探讨中止袭击的可能性，而易卜拉欣提出的最重要条件就是释放萨达姆，但是他的努力最后宣告失败。2006年12月30日，萨达姆被执行了绞刑。当听到萨达姆死讯后，易卜拉欣潸然泪下，还念了一段《古兰经》。萨达姆死后，易卜拉欣得到党内提名，出任复兴社会党党魁，成为萨达姆“接班人”，隐在幕后继续和占领当局作战。
美军对易卜拉欣恨得“咬牙切齿”，曾悬赏1千万美金要逮捕他。但是易卜拉欣行踪非常诡秘，在伊拉克被称为“幽灵”，12年来有关他被捕、死亡、自首的消息多次出现，但是随后都被逐一否认。2015年4月17日，在提克里特山区，伊政府军与什叶派民兵联手发动军事行动，在激烈交战中易卜拉欣被击毙。随后，伊拉克当局以玻璃棺材承载其尸体，运返巴格达交予卫生部门，引发了大批民众围观。
