然而，双方围绕该协议的一些细节仍存在较大分歧。韩国《韩民族日报》9月12日报道称，韩美协议的最大分歧在于韩国承诺的3500亿美元对美投资方案，双方在其构成、运作方式及利益分配上迟迟未能达成一致。
根据最初公布的有关内容，韩国政府对这3500亿美元的安排是1500亿美元用于韩美造船合作，剩余的2000亿美元则投入半导体、核电站、二次电池（又称充电电池或蓄电池）和生物技术等造船业以外的领域。但美国总统特朗普和卢特尼克认为，特朗普将"亲自挑选"投资项目，且90%的投资收益应该用于美国民众。
11日，卢特尼克拿着上周刚签订的美日贸易协议作为例子说，一旦特朗普批准像阿拉斯加天然气管道这样的项目，日本将提供项目资金，美国则负责雇佣建筑工人、建设管道，项目完成并产生收益后，美国和日本政府对半分配利润，直至日本收回投资，"之后，美国将获得90%的利润"。
但韩国总统办公室政策室长金容范9日表示，韩国不能接受与日本相同的条款。他指出，日韩两国的经济规模和外汇市场环境完全不同，日本拥有货币互换安排，日元还是储备货币，照搬条件将对韩国经济造成巨大冲击。而且对韩国来说，当前更紧迫的问题，不是谁做出基金投资决策或如何分红，而是韩国究竟要如何从外汇市场筹措并管理承诺投资的3500亿美元。
在美国Axios新闻网站11日发布的另一档节目中，卢特尼克还拿近期美韩关系中的另一场风波来向韩国施压。
"我们喜欢现代汽车在建的工厂，但他们需要为工人办理合适的签证。我的意思是，工作签证。"卢特尼克批评称，此前韩企为工人们办理的是旅游签证，入境后直接在工厂工作，这样是不行的。
卢特尼克称，他已亲自打电话敦促韩方为工人办理合适的签证，并告诉他们若遇到困难，可以直接找他联系美国国土安全部长克丽丝蒂·诺姆办理正确的签证。
美国移民执法人员4日对位于佐治亚州的韩国现代汽车和LG新能源合资电池工厂开展突击执法，以涉嫌"非法居留"为由抓捕475名工人，其中超过300人为韩国公民。美方称，这些人因非法入境、免签入境但没有工作许可、持有签证但逾期滞留等原因被捕。《韩民族日报》报道称，12日下午，316名被捕韩国工人已获释并抵达韩国仁川国际机场。
