作为国务卿，鲁比奥履行总统指示，于2025年4月启动国务院重组：大刀阔斧地裁撤百余个办公室、削减超700个岗位，精简人员15%；整肃所谓"觉醒主义"，将民主、人权与劳工事务局等机构定性为"左翼活动平台"，批评其"沉迷激进意识形态而忽视国家利益"；强化权力集中，合并特使办公室等机构。特朗普多次称赞鲁比奥是"非常受欢迎、深受爱戴"的团队成员，"将成为历史上最伟大的国务卿"。
不过，绝对服从之余，鲁比奥也在利用双重角色缓和特朗普的极端冲动，使自己成为好斗白宫中少见的理性沉稳面孔。在调停乌克兰危机的过程中，鲁比奥 与万斯、威特科夫等人一味对乌施压的强硬姿态拉开距离，暗中协调美国对乌援助不彻底"掉线"。在跨大西洋矛盾因格陵兰岛、价值观分歧等问题不断激化的过程中，鲁比奥利用出席慕尼黑安全会议的机会对欧洲进行安抚，动员其与美国一道"构建新的国际秩序"。在2026年2月美国对伊朗实施的"史诗怒火"军事打击行动中，鲁比奥全程参与决策，并与国防部长赫格塞思一起成为美方对外宣传该行动的主要面孔。行动初期，鲁比奥一直陪同特朗普在海湖庄园密切关注战况。他出面澄清军事打击"并非全面战争"，竭力缓解美国国内对于可能卷入长期战争的质疑。鲁比奥还在与古巴、委内瑞拉等国的互动中扮演关键角色。这些经历使他赢得部分共和党内精英和海外盟友的青睐。在国内事务上，鲁比奥同样小心翼翼，很少公开评论国内政治，也很少参与党派纷争，以免被视为"越权"或"心怀叵测"。
静待"接班"时机
进入2026年，鲁比奥已成为2028年共和党总统候选人的热门人选。保守派政治会议进行的草根民调显示，鲁比奥的个人支持率已从2025年的3%飙升至35%甚至更高，而万斯的支持率受乌克兰、伊朗问题辩论拖累从70%下降了10至20个百分点。《纽约时报》3月的一篇分析文章称，万斯虽然仍在保守派选民中"一骑绝尘"，但鲁比奥同样"势头强劲"。福克斯新闻也认为鲁比奥参选的"早期势能强劲"。
