20世纪80年代后期，我国紧跟国际推进自主的传输式陆地遥感卫星研制。为加强卫星地面和应用系统建设，吴美蓉同志1990年6月受命组建中国资源卫星应用中心并担任主任；面对当时压缩编制、精简机构的国家大环境，经过艰苦努力，在1991年10月5日成功完成创建。在此基础上，就各界对卫星地面和应用系统普遍缺乏重视的严峻形势，吴美蓉同志担任中巴资源一号卫星应用系统总设计师，组织形成了数十万字的论证材料，向国务院总理、副总理、国务委员到相关部委、各领域事企业单位等进行了数百次汇报和沟通协调，为我国陆地遥感卫星地面系统建设、应用推广和中国资源卫星应用中心发展奠定了坚实基础。
20世纪80年代至90年代初期，国民经济和社会发展对遥感的需求日益迫切。在原国家计委、国防科工委、航空航天部等指导下，由山西、湖南、江苏、甘肃、陕西等省市支持，酝酿组建我国遥感领域的国家级行业协会。吴美蓉同志积极参与、多方协调、大力组织、创新发展，支持全国地方遥感工作会议1992年8月在山西举行，决议成立"全国地方遥感应用协会"（2002年9月经民政部批准，更名为"中国遥感应用协会"），并依托当时新组建的中国资源卫星应用中心成立秘书处。吴美蓉同志1992年12月3日被原航空航天工业部任命为第一届理事会理事长，为协会创建、发展提供了重要支撑。
2000年后，吴美蓉同志以国际宇航科学院、亚太空间合作组织等为平台和抓手，积极从事国际宇航交流工作。2001年当选为国际宇航科学院（IAA）院士，后担任主席团成员和社会科学部主席。2002年担任亚太空间多边合作空间技术应用首席专家。
2014年，在美国华盛顿召开的世界航天局长峰会上，吴美蓉同志被授予"冯·卡门奖"，以表彰她50多年为航天事业和国际航天合作做出的突出贡献。吴美蓉是国际宇航界获此殊荣的第一位女航天科技专家。国际宇航科学院秘书长康坦先生盛赞吴美蓉院士，称在她身上体现了中国人勤劳勇敢、坚忍不拔、无私奉献的民族精神。
