而八旗刚刚崛起，本身是渔猎民族的女真人，性情凶悍，战斗力强大，努尔哈赤将其编为八旗，系统化的训练和指挥，更加充分的发挥了女真人的战斗力。因此单纯战斗力而言，普通明军并不如八旗兵。
努尔哈赤
第二，总指挥杨镐的懦弱无能。在萨尔浒战役之前，努尔哈赤甚至已经知道了杨镐四路大军的进兵路线。因此努尔哈赤可以从容指挥八旗，各个击破。而杨镐不过是攀附其党上台的人，他毫无军事才能，却依然被明朝政府任命为总指挥。对比军事强人努尔哈赤，根本不是对手。
第三，军事指挥系统的运转失灵。万历多年不上朝，使很多政府部门无法正常运转，其中就包括空缺了兵部尚书半年之久的兵部。没有兵部的协调指挥，动员10万人的庞大战役指挥失灵，筹备混乱，军事情报不断被泄露。而这10万大军，来自全国各地，彼此战斗力差异巨大，也毫无协调指挥，无法密切配合。
万历皇帝
第四，国库空虚，士兵粮饷皆不充足。万历三大征，虽然都取得了胜利，但也将万历中兴所积攒的财富耗用一空。国库空虚，萨尔浒之战的300万两军费，甚至通过加税才能勉强凑足。
