据悉，马毛岛基地建设花费预计超过3100亿日元，工期约4年。日本防卫省官方文件显示，马毛岛基地建成后，将成为一座美日共用的军事设施。日本自卫队可在此进行包括固定翼战机的机动部署、C-130运输机在简易跑道上的降落等多个科目的训练。美国航母舰载机也可在此进行陆上起降训练。
不过，海军研究院研究员张军社早前在接受采访时曾表示，从公开报道的情况看，马毛岛不仅将被用作美国海军航母舰载机的训练基地，还将供美军其他战机使用，包括目前美军驻冲绳基地的"鱼鹰"倾转旋翼飞机训练。他还分析认为，马毛岛面积很大，这意味着该基地建成后功能会很齐全，也足以驻扎更多美军兵力。它不但会成为媒体报道的一艘"不沉的航空母舰"，也会成为功能齐全的军事基地。
日本修建马毛岛基地供美军航母舰载机训练，自然遭到日本当地民众的强烈反对。此前，约5000名当地民众就发表联名书抗议在马毛岛建美军训练基地。有当地民众还表示，"这是迈向战争的第一步！"
