6月8日，芦芝镇政府工作人员一行来到陈美香的养殖田进行取样，并快递到福州某高校一名老师，由对方送到福州一家司法鉴定中心进行鉴定。不久后，鉴定结论显示，送检的蛙是牛蛙。
不过，陈美香对于这个鉴定报告的结论存在疑义，她请求镇政府对蛙再次进行鉴定，不过被拒绝。
在蛙被消杀之后，陈美香自己找到到了一个公证机构和厦门一家鉴定机构，找到了一些消杀后幸存的蛙进行鉴定，但请求政府部门工作人员见证被拒绝。而这家机构给出的鉴定结果则显示，送检的蛙种类为虎纹蛙。
潇湘晨报记者对比了两家机构的鉴定报告，前者采用的是DNA序列同源性的测试方法，后者采用的是外观观测法。
同时，陈美香一方对政府委托鉴定的过程也存在疑义。她厂里的一名工人称，当初政府部门过来采样时，取样的瓶子里已经就有了成体蛙。这些蛙是如何来的他们无从得知。
另外，陈美香说，政府方委托鉴定报告显示，进行检测的也是已经长了腿的蛙，而当时她田里的蛙都没有长腿。
《中国三农发布》节目援引中国水产科学研究院长江水产研究所研究员何力的话称，蛙类分子生物学检测在检测过程中相差不是很明显。相差不明显的况下，分子生物学还不一定完全正确。所以外形这一块的时候是非常重要的。
相关报道同时称，目前全国只有几个水产所拥有种植资源鉴定资质，司法鉴定机构目前并没有这个资质，而且只通过一项基因DNA，并不能将确定是否为牛蛙蛙类。
漳平市农业农村局局长邓长海则在相关节目中表示，芦芝镇政府委托鉴定过程中程序存在一定问题，没有按照农产品检验的方式留样，蛙苗取样应该取三份，一份交给鉴定中心进行鉴定，一份由卢芝镇政府存留，另一份由陈美香存留。一旦当事人认为鉴定报告有问题，马上可以检测存留样品。另一方面，镇政府委托的司法鉴定中心经营范围没有对应相关的检测范畴。
潇湘晨报记者查询镇政府委托的这家司法鉴定中心的资料，其经营范围为法医临床鉴定、法医毒物鉴定、法医物证鉴定、法医病理鉴定、文书鉴定、痕迹鉴定、林业物证鉴定。
