城内太平军屡次出城袭扰，曾国荃都令湘军都坚守壕垒，不轻易越壕迎战，屡挫太平军锐气。期间，太平军名将陈玉成部前来救援，也始终无法突破湘军的阵地。
这一场空前惨烈的战斗，双方拼杀了二十多天，陈玉成的精锐四千余人全军覆没。在赤岗岭投降的太平军和随刘沧琳突围被俘的太平军，也全部被湘军斩杀，刘琳本人被肢解。
1860年7月7日至8日，曾国荃和湘军水师配合作战，将陈玉成留在集贤关内和菱湖两岸的十八垒全部攻破，太平军八千官兵被杀光。
一月内，仅在集贤关内外，太平军阵亡一万多人。除在战场上杀戮外，曾国荃又下令把投降和被俘的太平军将士集体屠杀。
