明朝时期，锦衣卫设都指挥使（正二品）一人，都指挥同知（从二品）二人。就指挥同知来说，在官职品级上略微低于指挥使，在设立之初，指挥同知二人中，一人管练兵，一人管屯田，可以理解为锦衣卫指挥使的副手。
指挥佥事二人与都指挥同知分管屯田、训练、司务等事，为正四品的官职。在明朝时期，正四品官职的月俸为二十四石，而正三品的月俸为三十五石，差距是非常明显了。
在电影《绣春刀》系列中，镇抚使这一角色出现过。在锦衣卫中，分为南镇抚司和北镇抚司。其中，北镇抚司"专理诏狱"（皇帝钦定的案件），也即负责逮捕等事宜，而南镇抚司则是管理锦衣卫内部人员，也即一个对外，一个对内。镇抚使二人是从四品，在明朝时期，从四品的月俸为二十石。
