从武昌赶回来的翼王石达开试图制止韦昌辉的暴行。韦昌辉对翼王又恨又怕，就像除之而后快。翼王虽然侥幸缒城逃脱，但他留在天京的家眷全部遇害。石达开逃往安庆，国仇家恨集于一身，他从武昌等地调集四万精锐，讨伐韦昌辉。路上，石达开上奏天王，要求严惩屠杀自家兄弟的罪魁祸首。
平息内乱实乃人心所向，太平军官兵和天京军民绝大多数都支持石达开。韦昌辉人心丧尽，愈发孤立，成为众矢之的。洪秀全知道民心不可违，终于答应了石达开的请求，下诏惩凶除恶，诛杀韦昌辉、秦日纲。
韦昌辉见势不妙，试图做最后的垂死挣扎，他率部包围天王府，扬言准备发起火攻。天京军民对北王的恶行早已义愤填膺，于是相率来攻，经两日激战，斩杀北王心腹死党200余人，韦昌辉被生擒，随即被天王下令处以肢解酷刑。跟随他一同倡乱的燕王秦日纲、兴国侯陈承瑢也先后被枭首示众。
持续两个多月的天京事变虽然最终被平息了下来，但他给太平天国造成的巨创却再也无法弥补。数万久经沙场、经验丰富的忠诚老战士被屠杀，极大地削弱了太平军的战斗力，也给后期作战带来了巨大困难。清军则乘天京内讧之际发起疯狂反扑，并重建江北大营。之后，江南大营也被和春、张国樑重新建起。天京再一次被清军牢牢围住......在达到巅峰后，因集团内部领导层分崩离析，自相残杀，太平天国无法挽回的彻底走向了衰落。
