之后，吴中复参加科举考试，中了进士，并被朝廷授予峨眉知县一职。由于当地边境夷人建造祠堂太过繁多，在吴中复上任后一律废除了这些。他在任职期间为官清廉，后来被调回朝廷时，身上不曾携带任何一物。
不久，吴中复被任命为潭州通判，御史中丞孙抃举荐他吴中复为监察御史，起初他们二人并不相识，有人他问为什么要举荐吴中复时，孙抃说:"当初人们以自荐的御史为耻，如今难道有徇私情举荐御史的人吗？"
于是吴中复便迁任为殿中侍御史，在他上任之后就弹劾了当时的宰相梁适，宋仁宗说："马遵也说了这件事。"并问吴中复："自从唐天宝年间国家大乱，分分合合，为什么呢？"
吴中复引用姚崇、宋璟、张九龄、李林甫、杨国忠任免的事情来回答，等到他的任职期满，又被授予虔州通判，还未到达，便又被朝廷召回御史台。
