1908年11月13日，慈禧太后发布上谕："醇亲王载沣之子溥仪著在宫内教养，并在上书房读书。""醇亲王载沣著授为摄政王"。从事实上安排好了光绪皇帝的接班人。14日酉时，光绪皇帝驾崩于瀛台涵元殿。同一天，慈禧再颁懿旨："摄政王载沣之子溥仪承继穆宗毅皇帝为嗣，兼承大行皇帝之祧。"15日，慈禧崩于仪鸾殿。
【崇陵地宫金券内宝床上回复过后的光绪棺椁】
曾为光绪皇帝诊病的屈桂庭在光绪死后回忆了11月11日看病的情境：他到了瀛台，看见光绪皇帝在床上乱滚，大叫"肚子痛得了不得"，这种情况是与光绪皇帝本身的病毫无关系的。他的言外之意，是光绪皇帝的死另有隐情。随侍光绪帝多年的起居注讲官恽毓鼎则更为直接的指出："害先帝。立幼主，授载沣以重器，其祸实归于孝钦也。"末代皇帝溥仪在回忆录中谈到了小时候，老太监李长安告诉他的一件事：光绪在死的前一天还好好的，只是因为用了一剂药就坏了。著名书法家启功也曾说，他的曾祖父曾照顾慈禧和光绪的病，亲眼看见一个太监从慈禧居住的乐寿堂出来，给光绪皇帝送过"塌喇"（酸奶），送去之后不久，隆裕太后的亲信太监小德张就向太医院正堂宣布光绪皇帝驾崩了。
