后来叶芸越来越不信任程学启，程学启无奈之下，只能投降了湘军，然而程学启的老婆、孩子也都被叶芸杀死，成为曾国藩麾下的将领后，程学启一心想着为妻子报仇，后来在他的指挥下，安庆城终于被攻破，他给妻子报了仇。
然而程学启成为湘军将领之后，内心是非常郁闷的，因为他毕竟是太平天国的降将，曾国藩两兄弟根本不重用他，而且还经常对他进行嘲讽，尤其是曾国荃多次让他下不来台，郁闷的程学启一直想离开湘军队伍，可惜又无处容身，只能备受屈辱的待着。
曾国藩和曾国荃对程学启本没什么好感，既然李鸿章想要，自然也就做个顺水人情，直接送了过去，李鸿章大喜，想捡了宝似的，而程学启离开湘军加入淮军之后，深受李鸿章信任和重用，他果然不负众望，在后来的战争中攻城拔寨，战功累累，成为李鸿章的臂膀。
