即便后来明朝掀翻了元朝的统治也没有完成对东北的一统，但是女真与其说是受到大明的管辖倒不如说是处在一个半独立的状态，用一个更为先进的说法便是"一国两制"，其实这个看似很先进的概念其实在古代已经很普遍了，一般古代统治者面对生产生活方式不相同的地区都会采取这样的方式。
当时在明朝的统治地区属于农耕文明的都是采用流官，也就是由中央直接派遣官员下放到地方，但是对于边远地区的则是还是有他们的酋长一类人来掌管，当时一些偏远地区尽管地方不大同时人口也不多，但是这些地方在土司或是酋长的管理之下俨然就是一个小的王国，他们的位置同时也是可以世袭。
当时一些女真部落和明朝中央就像是猫捉老鼠，明朝强盛的时候女真就是老鼠受到明朝的制约，但是等到明朝末年明朝总体国力已经严重衰弱，这时候努尔哈赤等人便开始蠢蠢欲动，尤其在自己的多番挑衅之后明朝因为没有余力插手这边的事宜之后。
