大理寺丞李若朴、何彦猷以飞为无罪,与万俟卨竭力争议,均遭罢官处分。布衣刘允升上书为飞申冤,被下大理寺处死。已赋闲的韩世忠因岳飞入狱之事质问秦桧,桧回答:"飞子云与张宪书虽不明,其事体莫须有。"世忠忿然道:"相公,'莫须有'三字,何以服天下?"
十二月廿九日(1142年1月27日),宋高宗下达命令:岳飞特赐死。张宪、岳云并依军法施行,令杨沂中监斩,仍多差兵将防护。"
岳飞在大理寺狱中被杀害(宋代史料并无"风波亭"的记载),时年39岁;岳云和张宪被斩首。岳飞的供状上只留下八个绝笔字:"天日昭昭,天日昭昭!"岳飞的死讯传出,百姓们都为之哭泣;消息传到金国,金国大臣们为此酌酒庆贺,并说:"和议自此坚矣!"
岳飞被害后,狱卒隗顺冒险将岳飞遗体背出杭州城,埋在钱塘门外九曲丛祠旁。隗顺临终前,始将此事告知其子。1162年(绍兴三十二年)宋孝宗即位,岳飞冤狱终于平反。隗顺之子告以前情,乃将飞以礼改葬在西湖栖霞岭。1178年,宋廷为岳飞追赠谥号"武穆",宋宁宗时追封为鄂王,理宗时改谥忠武。
岳飞虽然被杀害了,但他的业绩不可磨灭。岳飞表达了被侵犯民族的要求,坚持崇高的民族气节,坚持了抗金的正义斗争,为汉民族的文明绵延起了中流砥柱的作用!岳飞联合抗金军民一道,保住了南宋半壁河山,使南中国人民免遭金人的蹂躏,从而保住了高度发展的中国经济和文化,并使之得以继续向前发展。