但是到了清朝，情况又发生了改变，建州女真崛起，从统一海西女真等诸部开始，最终走统一了天下，建立了大一统王朝。而关于宋辽金的正统问题，又出现了很大的争议，毕竟大清和金国属于同宗，在数千年前还是一家子，况且努尔哈赤最初建立的国家就是金国（史称后金），表明努尔哈赤是以金国为正朔的。而金取代的是同样发源于东北地区的辽，所以应当视辽金为正朔。但是清朝统一之后，情况又发生了变化，朝廷又开始争论宋辽金的正统性。
这个争论一直持续到了乾隆时期，特别是中后期，在修四库全书当中，争议颇大。最后乾隆乾纲独断，以宋室为正统，辽金为偏安，自此关于宋辽金的正统性争论才以宋室为正统，唐宋元明清代代传承而盖棺定论。
那为何出自女真族的乾隆会以偏安江南的南宋为正朔，而不以占据中原且同宗的金国为正朔？分析其缘由，主要有以下几点！
