因为戚家军在消灭外敌入侵的战役当中表现得十分出色，并且也是摧枯拉朽的胜利，所以在打败了外敌入侵回潮的时候，戚家军自然而然受到了朝廷的嘉奖。只不过当戚家军。三朝回府的时候还没有整顿休息好，就遇到了另一场战争，而这场战争也是明朝的内战。
因为当时，蓟州南部的军队造反了，而原因极其简单的是朝廷欠发军饷，而当时的百姓已经是民不聊生的了。所以当时的各个兵团为了争夺朝廷为数不多的军饷，也开打了起来。而当时的蓟州兵王就开始了大量屠杀官兵，而这些官兵也包括相当一部分精锐的戚家军，所以这一场战役也导致了戚家军元气大伤。
而第二场战役就是连续到数十年之后，戚家军再一次遭受到了威胁，那就是浑河之战了。而当时的戚家军派遣了大量的精锐与当时的游牧民族也是历史上鼎鼎大名的大将努尔哈赤所率领的队伍对阵。而这一场硬仗也让戚家军彻底的打败了，因为当时有很多士兵临阵脱逃，导致了，当时只有数千名戚家军的士兵大部分都战死在沙场，这也导致了戚家军的没落。
