首先，李渊攻打长安本是一场硬战，而守将阴世师等杀了李渊亲属、掘了李家祖坟，这让李渊非常生气，所以事后将阴世师等一批隋朝官员斩杀，由此可能牵连到了李靖。
其次，李渊立杨侑为帝，遥尊杨广为太上皇，除了"挟天子以令诸侯"政治目的之外，也给了隋朝官员台阶下，让隋朝官员投降李渊没有道德负罪感，因为还是隋朝的臣子，只是换了一个皇帝罢了。反过来说，不愿投降的隋朝官员，都是死硬分子，杨广死党李渊死敌，自然应该要被处死，其中可能也牵连到了李靖。
第三，李渊打下长安之后，不可能全部留用隋朝官员，但当时天下大乱军阀割据，也不能轻易放走，让他们怀恨在心投奔他人，最好的办法是杀一批隋朝官员。
因此，李渊破城之后，李靖与众多隋朝旧臣都被逮捕，不少人被押上刑场处死，其中就包括李靖。
然而，李渊可能对李靖成见较深，在唐平萧铣之战中，由于萧铣控制着峡州险塞，李靖受阻，迟迟不能前进，但李渊认为李靖怒其迟留，贻误军机，甚至心怀不轨，于是秘密命令许绍将他处死。许绍爱惜李靖的才干，为他请命，李靖这才免于一死。
参考资料：《旧唐书》
