到了之后他也没有冒进，更喜欢不费一兵一卒拿下对方，他知道自己的部将观童和元将乃儿不花是老相识，于是派他前去劝降，并且在观童和乃儿不花叙旧的时候悄摸摸包围了元军，，等乃儿不花发现时已经太晚，但是观童告诉他不用害怕，不会杀他，然后两人一起到朱棣帐中请降。帐中朱棣特意设宴款待，乃儿不花很感动，二话不说就归降了，朱棣因此大获全胜，军中威望愈高。
那时候朱元璋都夸他："肃清沙漠者，燕王也！"可见对他的倚重，所以朱棣一直以为自己是有机会能够当皇帝的，但是万万没有想到他一番辛苦付出，最后却是给朱标作嫁衣裳，而朱标死了之后他还是没有能得到皇位，又给朱允炆守这江山。慢慢的自然是心中怨气飙升，到后来直接不将朱允炆放在眼里，只是因为自己的妻儿被朱允炆设计囚在宫中，他才不得不蛰伏。
1399年6月朱允炆在他的死缠烂打之下，将他的儿子都放归了，朱棣再也没有了后顾之忧，7月末恰逢朝廷中有几个官员不干人事，于是朱棣借口清君侧，发动了"靖难之役"，和朝廷打了三年。朱允炆和朝廷的那帮人哪是他这种刀口舔血多年的人的对手，没有多久就兵败如山倒，朱棣顺利攻进了皇宫，预备完成篡位的最后一步。
