再后来的一系列战争中，比如甲午战争、鸦片战争，不论战前或战中，还是善后，慈禧太后都没有大包大揽一言九鼎，而是尽量让光绪帝作主。所以不管这场战争的结局怎样，也不管帝党后党如何纷争，慈禧太后与光绪帝并没有因为战争发生裂痕，他们的感情没有因为战争的失败受到影响。虽然没有产生裂痕，但是作为年轻气盛的光绪皇帝，自己还是想做些什么的。
光绪皇帝和慈禧产生矛盾是在戊戌变法上，因为当时清政府在战争失败之后，赔款赔地，使得很多国民都非常不满，于是就有了后来的戊戌变法，于是光绪毅然决然的接受了以康有为为首的戊戌变法。众所周知的是戊戌变法之中有一项就是把权力从慈禧这个疯女人手中取回来，皇上希望袁世凯可以起兵勤王，诛杀荣禄及包围慈禧住的颐和园，后来袁世凯将这件事透漏给慈禧，并借此邀功。
后来的结果大家都知道了，就是戊戌变法失败，光绪皇帝被软禁在瀛台，戊戌六君子被杀，在后来光绪皇帝被软禁的日子里，曾多次表示如果自己掌权会如何处理政史，最后光绪皇帝被慈禧下了毒药，将其折磨而死，根据野史记载，光绪在死之前还吊着一口气。赶紧让隆裕皇后过来，对着她交代后事，在她的手上写下四个大字，"杀袁世凯"。结果袁世凯没有被杀，反而成了推翻清朝统治的第一人，如果，当年袁世凯被杀，历史可能会改写吧。
