后来章太炎在日本认识了孙中山先生，辛亥革命后清朝宣告结束，1912年正式进入了民国，袁世凯又摘下了"胜利"的果实，成为总统，章太炎原以为袁世凯会励精图治，带领国家走向富强，没想到袁世凯一心想做的是"皇帝"。
起先章太炎不知袁世凯真面目，袁世凯让他去管理东北，章太炎就兴致勃勃的跑到了东北"兴办实业"，但宋教仁遇刺后，章太炎从美梦中惊醒过来，他认识了袁世凯的为人。
但袁世凯还在依仗章太炎，于是想法设法拉拢章太炎，可章太炎对袁世凯失去信任后，并不再与袁世凯为友，并且跑到总统府门前，将袁世凯大骂了一通。既然无法拉拢，袁世凯就派军警将章太炎抓了。
一般人入狱是吃不到好东西，也没有人专门伺候，章太炎就不同了，他除了活动范围只有那寸地方，随时能见的人是自己的弟子钱玄同，每月还能得到袁世凯发给他的500元生活费，并且配专用厨师伺候。
