早在其上位之初,刘裕就已经蠢蠢欲动,萌生了趁机将其灭国的想法。不过,彼时东晋内外交困,群臣以国力不足为由,很是反对。而慕容超因为把歌舞伎送给了姚兴,身边无人为其奏乐助兴,使他很是沮丧。
他干脆一不做二不休,直接让公孙五楼率军攻打济南府,劫掠当地的男女,为自己唱歌跳舞。如此一来,正好是给了刘裕以北伐的借口。不过慕容超哪里会是刘裕的对手,即便其御驾亲征,那也无济于事。刘裕甚至对其前往后勤找外援,不以为意。
他就等着后秦人前来支援,可好一网打尽。不过姚家也不傻,他们虽然明白唇亡齿寒的道理,但亦知道南燕是烂泥扶不上墙,即使派了援兵,也不过是炮灰。最终,慕容超本人在遁逃途中,遭遇东晋军队,他被带回建康,斩首示众。