成为元世祖的近臣之后，赵孟頫并没随波逐流，而是活出了自我。在朝中，赵孟頫公心谏言。有一次，大臣王虎臣揭发平江路总管赵全的违法事实，朝廷命王虎臣去查处。御史中丞叶李坚持奏请不可派王虎臣，忽必烈不听。最终，还是赵孟頫的一番话，敲醒了忽必烈："赵全违法确实应该问罪，但王虎臣以前在平江也常常强买民田，纵令下属臣僚奸诈营利。赵全曾多次与他争斗，王虎臣怀恨在心。如今派王虎臣去，他必然陷害赵全；纵然查出赵全不法事实，人们也不能不有所怀疑。"忽必烈这才明白过来，改派他人去处理。
在地方，赵孟頫细心理政。忽必烈有意让赵孟頫参与中书省政事，赵孟頫坚持不肯。他认为久在君王身边，必受人嫉妒，故极力请求到外地任职。至元二十九年（1292年），赵孟頫外出任同知济南路总管府事。当地有个叫元掀儿的人，在盐场服役，因不胜艰苦而逃走。他的父亲诬告是同服劳役的人将掀儿杀害。赵孟頫怀疑其中有冤情，不立即判决。一个月后，掀儿自己回归盐场。郡中人都称赞赵孟頫料事如神。
于朋友，赵孟頫不忘旧情。他原是因程钜夫的举荐而以兵部郎中入仕元朝的。后来程钜夫任翰林学士承旨时辞官归家，朝廷命赵孟頫接替他任职。赵孟頫就任后，先去拜谒程钜夫，然后再入翰林院视事，此事被当时传为士大夫的佳话。
