其实明朝灭亡的原因并不是清军入关，而是闯王高迎祥、李自成的农民起义推翻了明朝，建立大顺政权，然后关宁铁骑才引清军入关来灭了大顺。后金（清）的强势崛起，是引发农民起义的其中一个因素，但不是重点。
重点还是在于明朝政府自身拙劣的公共管理能力，在天灾的同时不但不能收取更多的工商税来赈济灾民，反而还要"三饷加派"，刮取更高的田税，这样势必造成大规模的农户破产，形成农民起义。
在镇压农民起义的过程中，明军的表现比面对外族时更加暧昧，军官贪污，士兵又都来自底层，和起义的农民其实是骨肉同胞。李自成的部队其实战斗力很差，甚至可以说连正规军都算不上，但明军就是节节败退，这不是战斗力的体现，而是明军根本不想打。
明思宗崇祯十七年（大顺永昌元年，清世祖顺治元年，1644年），闯军攻入北京，明军四散而逃，只剩下御马监的腾骧四卫、旗军、勇卫营这些皇帝私军以及一些魏忠贤当年训练的净军还在为皇帝浴血奋战。
不过大势已去，御马监就算真的有孙悟空，也挡不住大军压城。明思宗自缢煤山（在今北京市景山公园内），临死前抛下一句意味深长的话："朕凉德藐躬,上干天咎,然皆诸臣误朕。"（我固然是个德行凉薄的人，以至遭到上天惩处，但也是被诸臣所误。）
