坊间对冯玉祥评价低，主要是因为他太反复无常，屡次倒戈，二十来年间，他几乎背叛过所有跟过的大哥、盟友，比如袁世凯、曹锟、吴佩孚、段祺瑞、张作霖以及蒋介石。
史家质疑冯玉祥，主要在两件大事上：一是他1924年反戈曹锟政府后，把清王室彻底赶出了故宫。这么做，不管他有着怎样的动机，但在事实上却伤害了北洋政府的信誉，断绝了中国君主立宪制的最后希望，同时也给了日本人可乘之机。
二是1927年，冯玉祥任河南省主席期间，在省内大肆废寺逐僧，没收庙产，发动罕见的毁佛运动，将寺院改为学校、救济院、图书馆乃至市场、娱乐场所。
更不可原谅的是，他的这种粗暴乱弹琴后来扩大到了直、陕等地，整个华北佛教几乎因此衰绝。石友三更是借追击敌军之机，火烧少林寺，把天王殿、大雄殿、法堂和钟楼等建筑烧毁不说，还把许多珍贵的藏经、寺志、拳谱也烧成灰烬。
