岳飞被陷害死后，岳家军也遭到了朝廷的打击。对于岳家军中一些名望较高且忠于岳飞的，朝廷将这些人处死。
比如张宪和岳云，这二人就被下狱，后被处死。对于一些名望稍低的人，朝廷对他们进行安抚。像牛皋，朝廷将他派往外地，任一方大员。但是最后朝廷还是信不过他，派人秘密毒死了他。
还有一些对岳飞被害一事默不作声的人，朝廷就给这些人一点小恩惠。还有些比较低层的人同情岳飞的遭遇，朝廷将这些人下狱。
可以说，岳家军在岳飞被害以后变得支离破粹，南宋朝廷虽然可以放心岳家军不会因为岳飞被害而哗变了，但是却让整个南宋的战斗力大大下降。
对于岳家军中的士兵，朝廷将他们编入国防军或是御林军。宋金议和以后，南宋朝廷开始裁军，岳家军的一些旧部被裁撤。
