他先是参加黄巢起义，在里面混得不错。从军几年的朱温，追随黄巢转战南北，作战勇敢，屡立战功，迅速成长为一名独立的将领。黄巢攻占长安之后，命朱温率领军队防守渭桥，后又被任命为同州防御使，同州是黄巢政权在长安东面最主要的屏障，可见黄巢对他的信任和重用。
而后由于在黄巢军中受人排挤，心中不平。加上朱温发现当时形势已经不利于黄巢，于是他便叛离了黄巢，加入到唐军阵营。
朱温这次"叛变"对起义军打击很大，当时还躲在四川的唐僖宗非常高兴，立马给朱温封了个大官，还赐其名"全忠"。在古代，皇帝赐名，可以说是莫大的荣耀。没多久，很快，长安光复。为了进一步笼络朱温，唐僖宗又封他为汴州刺史、宣武军节度使，朱温摇身一变，成为了封疆大吏，雄霸一方，成为当时实力强大的藩镇之一，与河东节度使李克用一起肃清黄巢余部。
最终，历时九年的黄巢起义被镇压。黄巢起义转战大半个中国，长安和洛阳一度失陷，唐王朝已被推进了无法翻身的深渊，而朱温则趁机迅速壮大成为割据一方的大军阀。
