第一点就是沈万三不知变通，在明朝建立后沈万三跟朱元璋共筑南京城墙，在朱元璋想要重修南京城墙的时候，感觉自己已经被盯上的沈万三为了给朝廷效力，主动承担了城墙三分之一的铸造任务，但是没想到沈万三不仅比朱元璋亲自督建的城墙早完工三天，而且还比朱元璋建的城墙质量要好，一点都没给朱元璋留面子，被朱元璋记恨在心。
沈万三平时有什么话也都直说，不懂得拐弯抹角和变通，为此没少得罪朱元璋，长期以往累积下来也难怪朱元璋对他怀恨在心。
第二点就是沈万三乐善好施，乐善好施本来是好事，但是到了沈万三这种级别的富豪乐善好施的话，在皇帝的眼里就会变成邀买人心，沈万三基本上在遇到灾年或是百姓遇到困难的时候，都会给百姓布施粮食或者银子，如果他以朝廷的名义布施的话，朱元璋当然乐见其成，但是他却总以沈府的名义做这些事，而明朝刚刚建立，朝廷又拿不出银子，所以沈万三的所作所为就非常扎眼。
