这是能找到的毛文龙和袁崇焕最早见面的记录。毛文龙当时向孙承宗上交了几个首级和俘虏，而随着孙承宗来的袁崇焕再三仔细检查了首级，这是一件很吊诡的事情。袁崇焕是宁前道，他的职责是监督宁前总兵满桂，在毛文龙这里核验首级俘虏并不应该是他的工作，显然这是孙承宗的命令。而在这之前毛文龙的顶头上司登莱巡抚袁可立因为拒绝上报毛文龙的夸张战果而与毛文龙结怨，于是毛文龙伙同登莱浙党御史诬告袁可立使得他被罢职。这一次孙承宗却任由袁崇焕仔细核验首级战俘，明显就是有意敲打毛文龙。
毛文龙不傻应该明白，他心里也在这时记下了袁崇焕。而袁崇焕也不傻，他知道毛文龙不听指挥。而且在宁锦大捷后，袁崇焕只领了二百两银子却被阉党御史们喷得不得不回家守丧去了，而毛文龙却得到了厚赏，他的东江镇也从年饷银70万两增加到了银100万两。可谓一个上天一个下地。但没多久天启死后崇祯登基，与阉党关系密切的毛文龙转眼间成了崇祯的眼中钉，军费大砍减到了30万两每年。这个时候袁崇焕被重启，而且他明白，崇祯皇帝也对毛文龙有意见。
这点从袁崇焕到了京城一个月里，跟崇祯见了至少五次面商讨辽东之事后，袁崇焕向首辅明确表示毛文龙不服管束就除掉还保证没有任何问题就可以知道，杀毛文龙是崇祯的意思的，因此他才能这么笃定。结合日后崇祯和南明都拒绝给毛文龙平反就可以品出来，而且毛文龙手下也有人想他死，因为他被杀后也没见东江军有谁闹事，袁崇焕不但轻松离去还核算了皮岛全军数量，所以毛文龙应该是被自己人给卖了，而且这个人或这群人能控制住皮岛军队使他们没有因为毛文龙被杀而立即骚动。所以说，毛文龙之死，是明朝上下，还有他手下共同运作的结果罢了。
