第三层次也是最容易的忽视一点，1793年，清政府又颁布《钦定藏内善后章程二十九条》。这就说明清朝对西藏和青海的主权拥有法律上的依据。
5，最后的总结
[原文]清朝政府专设理藩院掌管蒙古族、藏族等少数民族事务，地位与六部等同。对于边疆地区采取因地制宜的政策，尊重各民族的社会习俗和宗教信仰，优待各族上层分子，取得了较好的统治效果。
清朝中期，疆域西跨葱岭，西北达巴勒喀什池，北接西伯利亚，东北至外兴安岭和库页岛，东临太平洋，东南到台湾及其附属岛屿钓鱼岛、赤尾屿等，南包括南海诸岛，西南抵喜马拉雅山脉。现代中国的版图至此奠定。在清朝疆域里，内地分立18省，各设巡抚为长官，每两省（个别地区为一省或三省）又设总督一名，相当于大军区长官。在东北、北部和西部边疆，分设若干将军辖区和办事大臣辖区。
[解析]清朝对待游牧民族采取了游牧民族的管理方式，对待汉族等农耕民族采取了汉族的治理方式，如在游牧地区设立将军府，实行宗教政教合一的控制等，在汉族地区推行了行省制，实行科举制，推行儒家文化等。这种制度最早从辽国的"南北院制度"开始，最终形成于清朝。这是中国二元帝国形成的制度保障。需要注意，这种制度和"以夷制夷"有很大的区别。不过可惜的是，清朝在改变了汉族的服装和发型，这是最大的污点之一。
