在这个征服的过程中，汉族人开始了强列的反抗，多尔衮也一意孤行的实行民族高压政策，发布"屠城令"民族文化被毁，汉族人民大量被屠杀，当时也站出来了许多民族英雄如史可法等，他们这捍卫的是民族生存。在当时看来要改变一个民族三千多年的传统和习俗，就是等于是要灭种了。
对比图
从而产生了"扬州十日"与"嘉定三屠"，后来又有了血洗江南、岭南，屠江阴、屠昆山、屠嘉兴、屠常熟、屠苏州、屠海宁、屠广州、屠赣州、屠湘潭。此外还有，屠大同、屠四川等等，清寇甚至勾结荷兰殖民者，攻屠思明州(厦门)。
反抗的仁人义士和大量百姓的尸体被推挤如山血流成河。在各个地方的地方志上都有记载，在清朝的历史记载中是没有的，也没有专门的书籍记载，因为历史是胜利者写的。在中国的杀戮上多尔衮实乃中国历史上第一大屠夫，至少有六千万人惨死，可能远不止这个数。
