玄武门之变之后，李世民成功登基，自然要进行一次大换血，以便自己全权掌控。大将军秦琼本来便也是李世民一直想要拉拢的人，再次之后定然是要提拔的，但是秦叔宝却一次又一次地称病，减少与李世民的见面次数，更不要说去带兵打仗了，李世民专门派人去给秦叔宝看病，太医熬好了药之后，秦叔宝打发了他走，而后便吩咐了人让把药倒掉。
秦琼跟了李世民这么些年，很清楚他的秉性，李世民不是卸磨杀驴之人，但是在经历过玄武门之变后，秦琼和李世民之间的感情，就淡了许多。在李世民杀死了单雄信的时候，秦琼的心就开始变冷了。对政治争斗有了排斥了厌恶。在经历过玄武门之变后，尽管当时箭在弦上，不得不发--再怎样变化倾轧，不过是他的李唐江山，自己只想要天下太平。
