清军在南下中原的时候，曾经任用了大批明朝的降将，这些人跟随着清朝的八旗军一起镇压南明政府，他们为清朝统一南方做出了重要的贡献。顺治帝在位时期，南明的永历政权覆灭，不过，由于这时那些汉族武装已经成势，顺治帝只好默许了他们割据一方的态势，这就有了以后的三藩：平西王吴三桂、平南王尚可喜、靖南王耿精忠。
三藩是满清对汉族功臣的特许，顺治帝本来就是想让他们镇守边疆，但随着他们野心的不断膨胀，才有了以后的三藩之乱。三藩之中，尤以吴三桂最为猖狂。吴三桂原是明朝的大将，在清军南下的时候，他主动投效清军攻打大顺民军，此人为清朝统一中原立下了大功，战后，顺治帝为了表彰吴三桂的功劳，将其封在了云南。
吴三桂前期还没有造反的意思，但随着多尔衮、顺治帝等这些满清重量级人物的相继离世，他才有了割据的野心。身为平西王，吴三桂大肆聚揽，他将云南彻底变成了自己的属地，甚至与朝廷分庭抗礼。公元1673年，按捺不住的吴三桂终于起兵造反，他联合其它两路藩王共同举兵，甚至一度进展到了湖南境内。
