除了招揽人才，扩充军队，他还悄悄地向官场渗透。一方面用重金收买朝中官吏，另一方面控制住他们的家人防止叛变，当时他所在的南昌地区几乎所有的官员都被他控制着。但是也有无惧生死，忠良正直之辈，他们不肯向朱宸濠妥协，其中的代表人物就是孙燧。
面对死活都不肯归顺他的孙燧朱宸濠非常头疼，为了阻止朱宸濠继续勾结盗冦危害当地百姓，他将家人全部送回老家，没有后顾之忧的他独自留在南昌敌人展开斗争。他对朱宸濠进行了真诚的劝诫，但是野心勃勃的朱宸濠怎么会听他的话，两人不欢而散，而且朱宸濠对他更加担心了，生怕孙燧会坏了自己称霸天下的大业。
后来，朱宸濠招募的盗冦开始祸乱百姓，孙燧立即组织人马进行围剿，眼看就要追上凶手，却突然失去了凶手的踪迹。很明显，这就是朱宸濠故意从中作梗，使他们无功而返。之后孙燧就此事向朝廷上书，然而都没有得到回应。原来他写给皇上的奏折根本就没出南昌城就被朱宸濠的眼线给截了下来。
这时候朱宸濠对孙燧也是恨之入骨，他先是收买了朝中的重臣，将孙燧调离南昌，还派人给他送去四样东西，分别是枣、梨、姜、芥。意为早离疆界，暗示孙燧不要多管闲事，小心惹祸上身。
