上台第二年，18岁的崇祯又犯下人生中的一大错误：斩杀袁崇焕。袁崇焕固然不是完人，毛病很多错误不少，但他的用兵才能和忠诚度是绝对毋庸置疑的。试问当时除了他，还有谁能稳定住行将崩溃的辽东战线，谁能连续击败努尔哈赤和皇太极两大枭雄。怀疑袁崇焕的忠诚度，暴露了崇祯眼光的拙劣和用人手腕的严重低能。袁崇焕这样不世出的人才，最起码崇祯可以先把他下狱，留他一条命在，以备异日之需。
杀这2人，尚且不足以对明朝产生致命影响，但他杀掉第三个人，则断送了明朝的最后希望。这个人就是登莱巡抚孙元化。当时世界范围内正在发生火器装备的换代升级，而明军大规模装备先进火炮、火枪，将使明朝在战场上获得无与伦比的巨大优势，宁远大捷、宁锦之战已证明，西洋火器是明军扭转战场劣势、抵消八旗骑射优势的不二法门。孙元化正是明朝唯一的火器专家。然而因为孙元化部下的一次叛乱，崇祯就无情地砍掉了他的脑袋。明军的火器装备升级换代也就此夭折，清军继续掌控了战场上的绝对优势，明朝覆灭也就没有悬念了。
