侯君集甚至告诉李世民："我担心大将军将来要反啊！"当皇帝的都有一些猜忌之心，李靖确实比侯君集的官大，又常常立下战功，在老百姓和士兵间都有声望，万一要反，不好对付，不过李靖向来忠心耿耿，打胜仗也是保家卫国，只因侯君集一言，恐怕不能当真。
于是李世民将李靖唤来，叫到面前责备了一番，便并问他为何不肯好好教侯君集，李靖就说："这是侯君集想要谋反，今日中原已经安定，我所教给他的，足以让他对抗周边族群，侯君集却贪得无厌想要学尽臣的兵法，这不是有异心是什么？"
但侯君集是个粗人，便没有表现出什么异常，李世民也不觉得侯君集有谋反的本领，因此并没有相信李靖的一番话，不过李靖和侯君集肯定就不愉快了，为了让两个臣子都冷静一下，李世民准许他们休息一段时间。
