高骈到成都后，派遣五千精兵追袭南诏军，一直追到大渡河，斩杀南诏酋长几十人。又在邛崃关和大渡河设城堡、栅寨，并于戎州马湖镇、沐源川筑城，从此以后，南诏再也不敢进犯西川。
嗜杀遭咒
高骈驱逐南诏后，为了震慑蜀人，先是将黎州刺史黄景复斩首，然后又将黄景复在蜀招募的突将禀给全部剥夺，又制定了系列的残酷峻法，此举立即遭到蜀人的反对。于是军中突将作乱，一直攻进成都府府舍。高骈派遣亲军出击，都被蜀人打败。高骈只好躲到厕所里去了。眼见局势即将失控，西川监军出面抚慰，承诺复给禀给，突将方才退出府舍。但是高骈在突将退出之后，命部将集结兵马，从后追袭，将参与作乱的突将数百人全部斩杀。
高骈恐蜀人不服，并将参与作乱的突将家属，不分老幼，尽皆处死。一时流血成渠，哭喊之声震天，被杀死者达数千人。夜晚，派人用车载以尸体投入江中。有一位妇女临刑时挥手大骂：“高骈！你无辜剥夺有功将士的职名和衣粮，激怒众人攻打府廷，虽有幸得以免死，不但不反省自己的错误，反而用狡诈奸计滥杀近万无辜士民，天地鬼神岂能容忍你如此作恶！我一定要到上天那里控诉你，使你象我今日一样举家遭屠灭，象我今日一样含冤受辱，象我今日一样遭受惊忧！”说完后向天跪拜，从容就刑。
拥兵自重
正当此时，王仙芝、黄巢起兵作乱。乱军自山东一路西进，准备先取洛阳，再攻长安。在河南受挫后，南下寇掠山南、淮南、荆南。唐僖宗诏命天下藩镇剿贼，乱军越战越勇。唐僖宗徙高骈为荆南军节度使，使其去剿灭王仙芝、黄巢。高骈会王铎及四方藩镇斩杀王仙芝，黄巢南下岭南。朝廷以高骈为镇海军节度使。广明元年，黄巢领兵北上，高骈派遣大将张璘、梁瓒阻击，大败黄巢。但是黄巢使用诈降计，高骈上当。黄巢斩杀张璘，领兵自采石渡过长江，高骈不敢反击。任凭黄巢领兵北上。黄巢一举攻入长安，唐僖宗逃往长安。唐僖宗屡次诏命高骈领兵北上勤王，高骈都以其他理由拒绝，直至长安被收复，高骈都不曾出兵。
