当时，农民起义已经遍布全国，政局十分动乱。李渊趁机召集了一支部队，起兵反隋。而这位隋炀帝的"表哥"的背叛，也给了隋王朝致命一击。李渊的目标很明确，直取长安，以便号令天下，建立新的王朝。大业十三年（公元617年）十月，李渊赶到灞上。经过一个多月的激战，终于攻陷了故都长安，俘获了留守在这里的杨侑。
李渊入长安后，觉得称帝的时机还不成熟，于是就效仿曹操的"挟天子以令诸侯"立杨侑为皇帝，改年号为义宁，遥尊隋炀帝为太上皇。李渊自己则晋封唐王，总揽军国大权，牢牢控制了长安的局势。聚拢关中集团力量，图谋天下。可怜才十三岁的杨侑成为了他"表爷"手里的傀儡道具，从此过上了有名无实，看人脸色的"皇帝"。
义宁二年（公元618年）五月，隋炀帝在江都被部将宇文化及杀死，杨侑这个傀儡皇帝对李渊也就没有任何用处。于是，李渊逼迫在位仅半年的隋恭帝杨侑禅让，自己在太极殿即位称帝，立国号为唐，年号武德，定都长安，隋朝由此灭亡。
杨侑被迫禅位后，被降为国公，过着隐秘寓居的生活。不过，这也只是暂时的，次年五月，李渊便派人将杨侑杀死。可怜的杨侑死时才15岁，被谥为"恭皇帝"。大隋王朝真正的最后一位"皇帝"的灭亡，也宣示着这个王朝的彻底覆灭，可怜才十五岁的杨侑，成为了权力角逐的牺牲品。后葬在陕西乾县，即庄陵。
