三月十三日（夏历三月初四日），清军引河工竣，第二天，放水淹浸，围堤以内，高处有水三、四尺，低处水深至五、六尺，太平军潜伏处，都有水三、四尺，火药、谷麦半被水浸。在水淹的第二天，太平军在西北面清军炮台附近埋的地雷，其火药袋、火药篓都被水漂出。从此地已遭水淹，不可能再用地雷轰塌围墙。三月二十九日（夏历三月二十日）以后，水势已经成围，难以飞渡重濠，但英勇的太平军决不在困难前低头，连夜向清军南北炮台进攻，企图突围，终因兵力太相悬殊，敌人又靠大水作围，都被阻截退回。
僧格林沁要活捉开芳，假说爱他才干，望他来投。开芳正在无计可施，以为何不如将计就计，竟出下策，於四月二十一日（夏历四月十三日），先派心腹先锋黄近文带领将士一百四十多人，混入难民内，齐出诈降，在外接应。他看见僧格林沁把诈降的将士用小船渡出重濠，以为敌人中计，到二十四日（夏历十六日）晨，大风骤起，飞沙扬尘，瞬息不辨南北。他就写一封诈降信给僧格林沁。僧格林沁要他先缴械。开芳带领将士，全副武装，乘坐小船，伪作前来缴械。他以为僧格林沁受降不会作防备，又有黄近文等在外接应，天又大风蔽日，正是突围的好时机，一到濠边，就可以乘此脱逃。不料僧格林沁早已看出他的诈降，先把黄近文等都杀死，绝了接应，到要渡他出濠时，又暗派马步队万多人张左右翼包围着。开芳既入敌人彀中，和将士都在濠边被擒。
僧格林沁将李开芳及他的部下黄恣端、谢金生、李天佑，谭有桂、韦名傅、曹得相，槛送北京，其馀将士一百多人，都在冯官屯被杀牺牲。开芳在路绝食，槛送官员屡次婉劝，均拒不食。
太平天国乙荣五年初五日（夏历四月二十七日），李开芳等七人在北京就义。敌人正绑黄懿端上身时，懿端飞脚把敌人踢死两个，踢伤两个，把敌人吓倒。到刑场时，观众万头攒拥，懿端高声对观众说：「自出天京，所向无敌，清妖不堪一击，灭亡就在眼前」。当敌人把开芳和懿端用寸磔酷刑凌迟处死时，他们都昂首扬眉，怒目四顾，表示蔑视敌人，英雄不屈的气概。
癸开十三年，太平天国叙开芳功，追封靖王，子李永保袭爵。
