在他掌握实权后，就开始对政事非常关心和把控，一上任就清算了张居正，不甘心受人掌控，想要赶紧建功立业，所以在他执政的前期朝廷被治理的非常不错，他很勤勉。
除了整治超纲之外，朱翊钧还开展了三大军事行动，平定宁夏叛乱，平定杨应龙叛变，援朝战争，可见他是一个一点也不昏庸甚至是十分迷恋权力的皇帝，那么为何在万历十五年的时候，他就不再临朝听政上早朝了呢？
万历皇帝执政中后期，几乎很少上朝。他处理政事的主要方法是通过谕旨的形式向下面传递。"万历三大征"中边疆大事的处理，都是通过谕旨的形式，而不是大臣们所希望的"召对"形式。而因为立太子之事与内阁争执长达十余年，最后索性三十年不出宫门、不理朝政、不郊、不庙、不朝、不见、不批、不讲。
