明朝军队主要由卫所、边军、京营三部分组成，其中卫所主要负责驻守全国各地，边军驻守九边重镇负责边防，京营驻守京城内外负责京城安全。明朝的军事编制其实主要以卫所制为主，所谓的京营和边军其实都是从卫所制演变而来，是对当地卫所的重新整编。
卫所
卫所是明朝全国各地的重要武装力量，以五军都督府为最高统帅机构。五军都督府下设都指挥使司、行都指挥使司和留守司，诸司下设卫所，一卫有5600人，其下分别设千户所、百户所、总旗、小旗等单位。
1、五军都督府：即中、左、右、前、后五军都督府，分别管理京师及各地卫所。各府分设左、右都督，正一品;都督同知，从一品;都督佥事，正二品。以中军都督府断事官为五军断事官。以上各职位均无定员。
2、都指挥使司(行都指挥使司)：设都指挥使一人，正二品;都指挥同知二人，从二品;都指挥佥事四人，正三品。
