顺治十五年，当时反清复明的代表人物、南明永历皇帝在清军围攻下，逃奔缅甸，南明小朝廷土崩瓦解。在江西孤军奋战的朱议滃得知这个消息后，深知大势已去难以挽回，再继续抵抗，只能让部下数千军民白白做无谓牺牲。经过深思熟虑后，他做出决定，带领部下放下武器，归降了清朝。《南明史》记载，"十二月，与都督王佑，经略彭坤文武百余人，兵三千余人诣南昌降清"。为了保住部下数千条性命，他做出了这个明智决定。
朱议滃被授予一个荣誉职衔骑都尉，但他的特殊身份和十几年的抗清经历，让清廷始终对他耿耿于怀，戒备重重。仅仅四年之后，康熙元年，清廷开始秋后算账了。朱议滃被强加一个莫须有的罪名，和众多家人一起流放到远离京师三千里外的辽东宁古塔。宁古塔处于极北苦寒之地，偏僻荒凉，几乎处于与世隔绝状态。大部分人从此再也难以回到中原，最终客死异乡。
在艰难困苦中度过多年后，康熙年间一道圣旨下达到宁古塔，朱议滃"奉到恩诏，着将被事官员等赦回原籍，给复原官"。对于被流放宁古塔的众多囚徒来说，能得到赦免回归故乡，无异于天降喜讯。然而朱议滃却表现得异常冷静。经过一番深思熟虑，他最初一个令人惊愕的决定，拒绝接受康熙的这道圣旨。他请宁古塔地方衙门代为上书朝廷，请求继续留在人们避之唯恐不及的宁古塔。
《宁古塔地方正黄旗朱姓全谱》记载，他给出的拒绝接受圣旨的理由是："人口众多，兼恋土难移，""距京路途遥远，无力回京，"因此请求准许他继续留在宁古塔，"充入宁古塔旗籍"。清廷也乐得让朱明王朝后人留在远离中原的编外蛮荒之地，也就顺水推舟同意了。此后朱议滃及其家人就正式在宁古塔定居下来，成为当地人一员。朱议滃晚年出家当了道士，《柳边纪略》记载，当时很多被流放宁古塔的囚徒都见过他。康熙四十五年，朱议滃安然去世。他身为朱元璋的子孙，明亡之后起兵反清，眼看大势已去，为了保住手下将士性命，归降清朝，获得了清廷谅解。被流放后，主动拒绝回到中原，避免了清帝的防范猜疑，每一个关键时刻他都做的恰到好处，所以才能安然无恙，最终全身而退，颐养天年而善终，表现出高超的生存智慧。
