在唐顺之远离官场期间，也有不少人推荐他重新出山，但是都被唐顺之一一拒绝了，也许唐顺之打定主意再也不踏入官场了吧。一直到倭患爆发，看见倭寇肆虐明朝沿海地区，百姓流离失所，唐顺之忍不住了，重新踏入仕途。多年的闭关修炼，让唐顺之具备了足够的积累，初掌军事的他一点也不生疏，反而很快就将一支缺乏训练，战斗力不强的军队训练成一支实力强劲，敢打硬仗的军队。在唐顺之的指挥以及身先士卒下，明朝军队取得了对倭的首次大捷，将倭寇重新赶回了大海之上。
而唐顺之也没有放弃继续打击倭寇，亲自率领明朝海军在大海上巡视，不过随着他"高负荷"视察军情、领军作战次数越来越多，唐顺之的身体扛不住了。此时的唐顺之知道还没有取得最终胜利，但是他的身体已经不足以支撑他完成这个目标，他迫切的需要一个传人，戚继光就是这么一个人。
