最后，当然是这场事变的源头，或者说策划者天王出面收拾残局了。天王又拉拢石达开和秦日纲来铲除韦昌辉，具体计划大致是翼王石达开在外围造声势，做大兵压境之状；燕王秦日纲在天京内联合天王势力来孤立和围剿韦昌辉，果然成了孤家寡人的韦昌辉扛不住了，被砍杀了，首级被送到了石达开的帅案上。
天京事变发展至此，翼王石达开成为赢家，手上不沾同胞血，还安抚受难受牵连的官民，太平天国上下对翼王的爱戴胜过天王。石达开入朝后，还提出了要严惩天京事变的帮凶陈承镕（排名第九）和秦日纲。天王突然犹豫了，因为他要的结果还没有实现。
眼前这个和架势和局面，石达开就是杨秀清、韦昌辉（第二个杨秀清）之后的第三个杨秀清。他想先留着燕王秦日纲和佐天侯陈承镕留下来，以制衡石达开，这样他就更安全。但石达开借助自己的声威和民愤迫使天王处死了这二人。
天王对石达开是有愤懑的，后来只好请两个亲哥哥出面（封王，挤兑、制衡），从而成功逼走了他。这才算天京事变的完结。不过，整个事件中，天王洪秀全自感有愧于燕王秦日纲和佐天侯陈承镕，为了弥补，对他们的兄弟子侄加以关照、重用。如天王后期重用陈承镕之侄陈玉成和厚待秦日纲的四个弟弟。
